培养方向不同。学术硕士教育以培养教学和科研人才为主；而专业硕士是注重应用实践能力的硕士学位，为培养特定职业高层次专门人才而设置。

招生条件不同。专业硕士分两种情况，一种情况要求报考者有一定年限的工作经历，如MBA、MPA，有些专业要求在职人员报考需经所在单位或相应管理部门的同意，有的甚至要求所在单位推荐；另一种情况，与学术硕士相同，并不要求工作经历。

学习方式不同。学术硕士全日制学习，学制一般为3年。专业硕士有全日制和非全日制学习两种形式，学制2-3年。

学习费用不同。学术硕士学费一般为低于专业硕士。

考试科目与难度不同。以英语为例，学术硕士考英语一，难度大于专业硕士要考的英语二

录取人数不同。学术硕士一般要求比较高，录取人数相较专业硕士要少。

认可度不同。学术硕士是全日制正规大学硕士毕业，拥有学历、学位双证，因此社会对学硕认可度非常高。但用人企业会考虑到全日制硕士研究生的弱点：光有理论，经验不足。专业硕士更注重实操，其社会认可度和求职地位已经大幅上升，不再区分专硕、学硕，而是更关注硕士研究生的含金量。